Während die Deutsche Demokratische Republik nach der Unabhängigkeit im Jahr 1975 diplomatische Beziehungen zu Mosambik aufnahm, folgte die Bundesrepublik Deutschland ein Jahr später. Seit 1985 ist das Abkommen über Technische Zusammenarbeit in Kraft, seit 1997 das Abkommen über kulturelle Zusammenarbeit.

Viele Staatsangehörige Mosambiks studierten in der DDR, rund 20.000 waren als sogenannte Vertragsarbeiterinnen und -arbeiter dort tätig, es bestehen daher weiterhin teils enge persönliche Beziehungen nach Deutschland. Deutschland hat den Friedens-, Versöhnungs- und Stabilisierungsprozess in Mosambik umfassend unterstützt.

Die Entwicklungszusammenarbeit (EZ) ist ein Schwerpunkt der deutsch-mosambikanischen Beziehungen. Bei den letzten Regierungsverhandlungen im Juni 2024 in Berlin wurde eine Klima- und Entwicklungspartnerschaft (P+) mit Mosambik vereinbart in deren Zentrum der Ausbau erneuerbarer Energien, Investitionen in Stromnetze, Ausbildung von Fachkräften für den Aufbau regenerativer Stromquellen und die Klimaanpassung stehen. Bereits im November 2023 ist Mosambik dem G7-Klimaclub beigetreten. Schwerpunkte der bilateralen Entwicklungszusammenarbeit sind die drei Kernthemen 1) Frieden und gesellschaftlicher Zusammenhalt; 2) nachhaltige Wirtschaftsentwicklung, Ausbildung und Beschäftigung sowie 3) Klima und Energie, Just Transition. Deutschland beteiligt sich ebenfalls an Unterstützungsprogrammen der Europäischen Union und multilateraler Institutionen.

Für Deutschland ist Mosambik drittwichtigster Handelspartner in der Entwicklungsgemeinschaft im südlichen Afrika (SADC). Das bilaterale Handelsvolumen mit Mosambik belief sich 2024 auf rund 246 Millionen Euro. Den Großteil der mosambikanischen Exporte nach Deutschland macht Aluminium aus. Im Jahr 2024 lag der Wert der deutschen Exporte nach Mosambik bei 63,1 Millionen Euro, während mosambikanische Exporte nach Deutschland im Wert von 182,9 Millionen Euro getätigt wurden. Zusätzlich werden viele Im- und Exporte über die Niederlande und Südafrika abgewickelt.